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基因数据处理50之cs-bwamem、bwa、snap、bwa-mem与art比较
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-09 热度：142
副标题#e# 直接看结果： （1）art仿真数据： hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ cat G38L100c50Nhs20.aln ##ART_Illumina read_length 100@CM art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522.fna -l 100 -c 50 -o G38L100c50Nhs20[详细]
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基因数据处理45之cloud-scale-bwamem安装（compile.pl安装有问题
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-09 热度：138
脚本： hadoop@Master:~/xubo/tools/cloud-scale-bwamem$ cat compile.pl #! /usr/bin/perlsystem "mvn clean package";chdir "./src";system "mvn package -PotherOutputDir";chdir "./main/jni_fpga";system "mvn package -PotherOutputDir";chdir "../a[详细]
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基因数据处理47之ART基因序列数据生成器（仿真）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-09 热度：198
1.概念： ART基因序列数据生成器 详细请见论文：【1】 和官网【2】 2.下载： ART-bin-GreatSmokyMountains-04.17.16-Linux64.tgz http://www.niehs.nih.gov/research/resources/assets/docs/artbingreatsmokymountains041716linux64tgz.tgz 3.配置 sudo cp[详细]
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基因数据处理49之cloud-scale-bwamem运行成功
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-09 热度：141
副标题#e# 1.先使用art生成数据： 请看前一篇 2.上传fastq到hdfs： hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ spark-submit --class cs.ucla.edu.bwaspark.BWAMEMSpark --master local[2] /home/hadoop/xubo/tools/cloud-scale-bwamem-0.[详细]
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基因数据处理48之ART使用实例
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-09 热度：178
副标题#e# 相关参数请见上一篇 1.使用实例1： hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522.fna -l 100 -f 20 -o G38L100F20Nhs20 ====================ART==================== ART_Illumina[详细]
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求0至大数之间的随机数
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-09 热度：191
题目：给定一个String类型的大数(非负整数)，不能直接转化为Integer，类似如下要求 The numbers can be arbitrarily large and are non-negative. Converting the input string to integer is?NOT?allowed. You should?NOT?use internal library such as?B[详细]
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??攻略｜13招神技 让你在数据科学和数据分析工作中脱颖而出
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：53
副标题#e# 简介：我有幸在很早参与了一个大数据科学项目，我非常喜欢其中的工作，甚至我意识到我的努力可以增加一些公司的价值。 然而，可悲的是，只有不到30%的数据科学项目最终实施了。我备受打击的意识到我的努力被浪费了。但是，我不是唯一的一个。几乎[详细]
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基因数据处理46之cloud-scale-bwamem安装（compile.pl安装没问题
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：172
版本：https://github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem/releases/tag/v0.2.1 1.需要设置spark路径： !--systemPath/cluster/spark/spark-1.3.1-bin-hadoop2.4/lib/spark-assembly-1.3.1-hadoop2.4.0.jar/systemPath -- systemPath/home/hadoop/cloud/sp[详细]
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基因数据处理51之cs-bwamem集群版运行*
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：174
将master的local改为集群就可以了。 集群运行结果： 问题： 匹配50条的时候，bwa和snap都是生成50条。但是cs-bwamem会生成492条，其中25和50条重读的很多，匹配位置不同。不知道为啥？ 记录： D:1win7javajdkbinjava -Didea.launcher.port=7538 "-Did[详细]
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![《剑指offer》:[16]打印1到最大的N位数](/uploads/allimg/c210308/161521294416230-110V.gif)
《剑指offer》:[16]打印1到最大的N位数
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：162
题目：输入数字N，按顺序打印从1到最大的n位十进制数。比如输入3，则打印出1、2、3一直到最大的三位数即：999. 乍一看这个题目很简单，我们很快就会写出下面的代码： void onetoN(int n){int number=1;for(int i=0;in;i++){number*=10;}for(int i=1;inumbe[详细]
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基因数据处理52之cs-bwamem集群版运行（1千万条100bp的reads）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：190
副标题#e# 1.art生成模拟序列： art_illumina -ss HS20 -i GRCH38BWAindex/GRCH38chr1L3556522.fna -l 100 -c 10000000 -o g38L100c10000000Nhs20 2.上传到hdfs，制定partition数 spark-submit --class cs.ucla.edu.bwaspark.BWAMEMSpark --master spark://[详细]
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NDK开发 - JNI数组数据处理
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：97
副标题#e# 很多时候利用 NDK 开发都是为了对数据进行加密操作，因为单纯的 Java 太容易被反编译了，加密算法也就很容易被破解，而利用 C/C++ 开发可以加大破解难度。文件的数据加密就需要通过 byte 数组传给 JNI。 传送门：NDK开发 - JNI数组数据处理 JNI[详细]
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利用BI搭建零售业数据信息平台
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：196
某百货公司是全市规模最大的以零售为主、多元化经营的股份制商业企业。拥有员工数千人，经营国内外品牌2300余种，年商品销售额逾10亿人元。 销售体量如此庞大的企业近几年在IT建设上出现了问题，集团内部的信息化数据有些跟不上业务扩张的步伐。虽然该集团[详细]
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BZOJ 1670 [Usaco2006 Oct]Building the Moat护城河的挖掘
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：190
Description 为了防止口渴的食蚁兽进入他的农场，Farmer John决定在他的农场周围挖一条护城河。农场里一共有N(8=N=5,000)股泉水，并且，护城河总是笔直地连接在河道上的相邻的两股泉水。护城河必须能保护所有的泉水，也就是说，能包围所有的泉水。泉水一定[详细]
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基因数据处理70之Picard安装没成功
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：176
1.下载： https://github.com/broadinstitute/picard.git 2.安装： hadoop@Master:~/xubo/tools/picard$ ant clone-htsjdkBuildfile: /home/hadoop/xubo/tools/picard/build.xmlclone-htsjdk: [exec] Cloning into 'htsjdk'... [echo] Checking out HTSJDK[详细]
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OBIEE RPD开发
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-08 热度：147
A parent-child hierarchy is a hierarchy of members that all have the same type. This contrasts?with level-based hierarchies,where members of the same type occur only at a single level of the?hierarchy. The most common real-life occurrenc[详细]
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Twitter发布新的大数据实时分析系统Heron
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：58
Twitter发布新的大数据实时分析系统Heron http://geek.csdn.net/news/detail/33750 Twitter Heron的深入解析(与Storm的比较) http://www.tuicool.com/articles/2mMZver[详细]
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NMEA-0183之$GPRMC数据处理
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：111
副标题#e# NMEA-0183 u?以下为GPS芯片串口发出的数据： 201512_15:42:3712,$GPTXT,ANTSTATUS=SHORT*43 201512_15:42:37$GNGGA,074219.000,3021.516740,N,12005.998703,E,1,9,1.09,20.996,M,6.991,*42 201512_15:42:37$GNGLL,A,A*45 201512_15:42:37$GPGSA,3[详细]
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【工作帮】微盟数据中心招数据分析师，薪资open
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：59
坐标：上海 微盟：C轮创业公司，投资方包含腾讯、海航等实力资本，拥有toB和toC的电商业务，广告和理财为蓄力点，发展迅速。 微盟数据中心：承接整个集团的数据，体积大，种类多，想象力丰富 微盟数据中心数据分析师：Growth Hacking的推动者，从数据中发[详细]
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使用Zeppelin来实现大数据分析的可视化
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：143
Apache Zeppelin是ASF的一个孵化项目，实现了基于web的在线代码编辑与数据可视化。有点类似Spark-Shell的REPL。其结果可以直接用图表来展示，解决了前端白痴的苦逼。 Zeppelin官网 我们可以直接下载 zeppelin-0.5.6-incubating-bin-all.tgz ，然后部署到服[详细]
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初识聚类算法:K均值、凝聚层次聚类和DBSCAN
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：127
http://blog.sina.com.cn/s/blog_62186b460101ard2.html 聚类分析就仅根据在数据中发现的描述对象及其关系的信息，将数据对象分组(簇)。其目标是，组内的对象相互之间是相似的，而不同组中的对象是不同的。组内相似性越大，组间差别越大，聚类就越好。 先[详细]
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基于K－Means的文本聚类
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：99
http://blog.csdn.net/freesum/article/details/7376006 何为聚类 ? ? ? ? “聚类是把相似的对象通过静态分类的方法分成不同的组别或者更多的子集（subset）,这样让在同一个子集中的成员对象都有相似的一些属性。”?? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?[详细]
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R在文本挖掘与分析的妙用：分词、画词云
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：137
副标题#e# 报道大数据企业：大数据产品、大数据方案、 ? 大数据人物 分享大数据干货：大数据书籍、大数据报告、 大数据视频 本文转自蔡捕头的新浪博客。欢迎更多优质原创文章投稿给大数据人：289585305@qq.com 摘要：要分析文本内容，最常见的分析方法是提[详细]
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10EB量级的基因大数据处理技术
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：116
Java学习网（www.javalearns.com）提拱 10EB量级的基因大数据处理技术 很荣幸在这里跟大家分享大家以前很少接触到的领域的大数据情况。其实生命科学的大数据还处在比较初始的阶段，否则国家也不会现在才开始提出精准医学这样的概念。所谓精准医学想通过大[详细]
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数据分析与挖掘学习（一）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：127
数据分析与挖掘过程 一. 定义挖掘目标 一般的数据挖掘任务包括： 1. 分类与预测 2. 聚类分析 3. 关联规则 4. 时序模式 5. 偏差检验 6. 智能推荐 二. 数据取样 抽取一个与挖掘目标相关的样本子集，标准是 1. 相关性 2. 可靠性 3. 有效性 而不是选用全部数据[详细]
